重庆医科大学原名重庆医学院，成立于1956年，由上海第一医学院（现复旦大学医学院）分迁来渝组建而成。1985年更为现名。曾隶属于卫生部、四川省人民政府，现隶属于重庆市人民政府。历经五十年的发展，重庆医科大学已成为一所具有“学士-硕士-博士-博士后”完整人才培养体系的地方重点大学。
        学校占地面积190万平方米，建筑面积90万平方米。固定资产总值20.89亿元，其中教学、科研、医疗设备总值7.14亿元，藏书109万册(含电子图书)。
        学校现设研究生学院、基础医学院、临床学院、第二临床学院、儿科学院、中医药学院、应用技术学院、公共卫生学院、管理学院、药学院、口腔医学院和护理学院12个学院和8个系（部）、1所卫生学校。设置专业有临床医学、临床医学（儿科医学方向）、临床医学（生殖医学方向）、临床医学（援救医学方向）、临床医学（全科医学方向）、口腔医学、医学检验、医学检验（生物医学技术方向）、医学检验（检验应用技术）、预防医学、预防医学（卫生检验方向）、医学影像学、麻醉学、生物医学工程（医疗器械方向）、英语（医学英语方向）、信息管理与信息系统（医药卫生方向）、中医学(中西医结合方向)、中药学、中药学（中药制剂方向）、护理学、护理学（护理应用技术方向）、药学、药学（药物应用技术方向）、公共事业管理（卫生管理方向）、公共事业管理（医事法律方向）共32个本科专业及专业方向；有附属医院5所，其中三所医院为三级甲等医院,附属第三医院正在筹建规划阶段。共有病床近2792张，年门诊量263.22万人次，年收治住院病人8.97万人次。非直管附属医院4所，教学及实习医院21所。
        在校学生21248人，其中博士生346人，硕士生1963人，普通本、专科生(高职)14804人；成教本专科生3825人，留学生310人。
        在职职工4864人，其中正高级专业技术人员265人；副高级专业技术人员791人；中级专业技术人员1540人。教师中入选教育部“长江学者和创新团队发展计划”1项；入选国家“百千万人才工程”第一、二层次人选3人，“新世纪百千万人才工程”国家级人选3人；入选教育部“新世纪优秀人才支持计划”1人，“跨世纪优秀人才”2人,，“高等学校骨干教师资助计划” 9人，“优秀青年教师资助计划”8人；获霍英东教育基金青年教师基金、青年教师奖基金资助4人；国家级、省级有突出贡献的中青年专家10人；外聘重庆市“巴渝学者特聘教授”岗位1人；重庆市杰出专业技术人员1人、重庆市优秀专业技术人员7人；入选重庆市“322”人才工程第一层次人选3人、第二次人选15人；重庆市首批学术技术带头人38人、重庆市首批学术技术带头人后备人选46人；重庆市高校中青年骨干教师24人、入选“重庆市高等学校优秀中青年骨干教师资助计划”教师74人；有117位专家、教授享受政府特殊津贴。
        现有国家级重点学科3个，省市级重点学科29个；国家工程研究中心1个，省部共建实验室3个，省重点实验室6个；有11个研究所，3个研究中心，20个研究室；有博士后流动站3个，博士学位授权点二级学科26个，硕士学位授权点二级学科53个；博士生导师185名。       
        学校先后承担了国家"六五"至"九五"科技攻关项目及国家自然科学基金重点和面上项目、863计划项目、国家杰出青年基金项目、国家新药基金项目、教育部跨世纪人才基金项目等高层次科技项目，同时还承担国际合作项目的研究。2005年执行各级科研项目800余项，在国内外学术刊物上公开发表论文1903篇，据中国科技信息研究所、信息分析中心关于2005年论文检索结果的分析报告获悉，我校在国内重要期刊发表论文排序居全国各类高校第42位。学校出版的《重庆医科大学学报》、《中华肝脏病杂志》、《临床超声医学杂志》、《儿科药学杂志》和《医学教育探索》等刊物，面向国内外公开发行。自1978年以来，获国家科技进步奖、技术发明奖及部、委、省等各级科技成果奖520项。我校研制的聚焦超声肿瘤治疗设备（超声聚焦刀）属世界首创，是我国第一台具有完全自主知识产权的大型医疗仪器，实现产业化以来，已在重庆、北京、广州、南京、成都等地多家大医院进行上千病例治疗，疗效显著。目前，“海扶刀”已出口亚洲、欧洲多个国家。
        改革开放以来，学校先后与美、英、加、日、俄、法、德、澳、荷兰、瑞士等国家及香港地区的大学建立了学者进修、留学、参加学术交流和科学研究等合作关系，聘请了86位来自美、日、英、法、德、加拿大、澳大利亚、瑞典、荷兰、泰国及香港地区的医学专家为我校名誉教授和客座教授。